Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV89

SH2D5, SH2 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D5Q6ZV89 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SH2D5Q6ZV89 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2D5Q6ZV89 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D5Q6ZV89 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms