Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms