Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00173Q6ZV60 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00173Q6ZV60 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms