Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPGS1Q6ZTW0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms