Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC00299Q6ZSB3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00299Q6ZSB3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00299Q6ZSB3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms