Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP6Q6ZN66 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms