Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATRAIDQ6UW56 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms