Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC171Q6TFL3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC171Q6TFL3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms