Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMARCD3Q6STE5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.2 ms