Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP17L2Q6R6M4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L2Q6R6M4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms