Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBED9Q6R2W3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZBED9Q6R2W3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms