Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms