Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms