Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD3Q6PCD5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFWD3Q6PCD5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms