Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC70Q6NSX1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms