Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CENPPQ6IPU0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPPQ6IPU0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms