Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLFN12LQ6IEE8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLFN12LQ6IEE8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms