Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC19Q6DKK2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC19Q6DKK2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC19Q6DKK2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms