Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
VIRMAQ69YN4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VIRMAQ69YN4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VIRMAQ69YN4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms