Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA2Q69YH5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA2Q69YH5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA2Q69YH5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA2Q69YH5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA2Q69YH5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA2Q69YH5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA2Q69YH5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA2Q69YH5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA2Q69YH5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms