Protein–RNA interactions for Protein: Q68D42

TMEM215, Transmembrane protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM215Q68D42 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM215Q68D42 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM215Q68D42 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM215Q68D42 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM215Q68D42 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM215Q68D42 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM215Q68D42 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM215Q68D42 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM215Q68D42 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms