Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG16L1Q676U5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG16L1Q676U5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG16L1Q676U5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms