Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM46CQ5VWP2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms