Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GARNL3Q5VVW2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms