Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFMBT2Q5VUG0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFMBT2Q5VUG0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFMBT2Q5VUG0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms