Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SOGA3Q5TF21 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOGA3Q5TF21 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms