Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1TD1Q5T7N2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1TD1Q5T7N2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms