Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP2LQ5T4T6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2LQ5T4T6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP2LQ5T4T6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms