Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZFYVE27Q5T4F4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZFYVE27Q5T4F4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms