Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HECTD3Q5T447 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECTD3Q5T447 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms