Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
CEP170Q5SW79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CEP170Q5SW79 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CEP170Q5SW79 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CEP170Q5SW79 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms