Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM240Q5SV17 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM240Q5SV17 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms