Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PITRM1Q5JRX3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PITRM1Q5JRX3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms