Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MIA3Q5JRA6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MIA3Q5JRA6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms