Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A13Q5J8X5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A13Q5J8X5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms