Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR3Q5GH77 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR3Q5GH77 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms