Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ODF2Q5BJF6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ODF2Q5BJF6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ODF2Q5BJF6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms