Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSP90AB4PQ58FF6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HSP90AB4PQ58FF6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HSP90AB4PQ58FF6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms