Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KHDC3LQ587J8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KHDC3LQ587J8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms