Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL22Q53GT1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL22Q53GT1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL22Q53GT1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms