Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC23Q53EV4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC23Q53EV4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms