Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKDCCQ504Y2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms