Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1LQ4VXU2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1LQ4VXU2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms