Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP221Q4G0U5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP221Q4G0U5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms