Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDNFQ49AH0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDNFQ49AH0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms