Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LONRF3Q496Y0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LONRF3Q496Y0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms