Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H1Q32P28 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P3H1Q32P28 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P3H1Q32P28 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms