Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL38Q2WGJ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL38Q2WGJ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms