Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR1Q2NL82 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR1Q2NL82 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms