Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERCC6LQ2NKX8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC6LQ2NKX8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms